基于生物信息学分析GLIS3在胃癌中表达与免疫浸润的临床意义

目的研究GLIS3在胃癌中的表达与预后价值,探索GLIS3在胃癌中免疫细胞浸润情况及其参与的生物学功能。方法从TCGA数据库中下载胃寻找更多癌患者GLIS3基因表达谱数据及临床病理信息,比较胃癌组和正常对照组中GLIS3的表达差异,分析GLIS3表达与胃癌患者临床病理特征的关系。利用确认细节Kaplan-Meier法和Cox回归分析GLIS3表达与胃癌患者临床预后相关性。运用miRWALK、TargetScan及TCGA数据库,预测调控GLIS3异常表达的miRNA。利用GSEA富集分析预测GLIS3在胃癌中可能参与的信号通路。使用TIMER2.0分析GLIS3表达与免疫细胞浸润之间的关系。结果GLIS3在胃癌组织中表达明显上调(P<0.05),且GLIS3的表达与肿瘤组织学分级相关;生存分析显示GLIS3高表达患者比低表达患者预后更差,差异有统计学意义(P<0.05),是胃癌的独立预后因素(HR=1.288,95%CI:1.004-1.653,P<0.05)。miR-204-5p在胃癌中表达明显下调,并且与GLIS3表达负相关(P<0.05)。富集分析结果显示:GLIS3基因主要富集在ECM受体相互作用、肿瘤、紧密连接等信号通路。免疫浸润分析结果显示GLIS3表达与CD4+T细胞、巨噬细胞、中性粒细胞和树突状细胞相关(Dynamic medical graphP<0.05)。结论GLIS3在胃癌中表达上调,可作为胃癌的诊断和预后的标志物,且与免疫浸润有关。