目的：探讨贝达喹啉联合抗结核药物对耐多药肺结核患者短期疗效C59化学结构及对免疫功能和炎性因子影响。方法：选择本院2019年3月—2021年3月耐多药肺结核患者120例，按随机表法分为观察组和对照组各60例。对照组口服盐酸莫西沙星片0.4 g/次，1次/d；口服利奈唑胺片0.6 g/次，1次/d；口服吡嗪酰胺片0.75 g/次，2次/d；口服丙硫异烟胺肠溶片0.2 g/次，3次/d。观察组在对照组基础上加服贝达喹啉片，最初2周400 mg/次，1次/d，第3周起200 mg/次，3次/周。两组疗程均为24周。比较两组治疗24周短期疗效，治疗12周和24周痰菌转阴情况，治疗前与治疗24周免疫功能和炎性因子变化及不良反应情况。结果：观察组耐多药肺结核患者短期总有效率（90.00%）高于对照组（73.33%）(P<0.05)。观察组耐多药肺结核患者治疗12周和24周痰菌转阴率为51.67%和66.67%，高于对照组的33.33%和46.67%(P<0.05)。对照组治疗24周耐多药肺结核患者CD3~+、CD4~+和CD4~+/CD8~+较治疗前无显著差异（P>0.05）；观察组治疗24周耐多药肺结核患者CD3~+、CD4~+和CD4~+/CD8~+较治疗前升高（P<0.05）；观察组治疗24周耐多药肺结核患者CD3~+、CD4~+和CD4~+/CD8~+高于对照组（P<0.05）。两组治疗24周耐多药肺结核患者血清C反应蛋白（CRP）和白介素-6(IL-6)水平较治疗前降低，而白介素-2(IL-2)水平Library Prep较治疗前升高（P<0.05）；观察组治疗24周耐多药肺结核患者血清CRP和IL-6水平低于对照组，而IL-2水平高于对照组（P<0.05）。两组不良反应比Entinostat NMR较无显著差异（P>0.05）。结论：贝达喹啉联合抗结核药物对耐多药肺结核患者短期疗效良好，且可提高患者免疫功能，减轻患者炎性反应。