水稻作为世界上重要的粮食作物之一,是全球超过一半人口的主要食物来源。随着科技的发展与进步,越来越多的水稻品种的基因组序列已被完整测序,许多与重要农艺性状和抗逆性状相关的基因也已被鉴定和研究,这些成果推动了水稻功能基因组学研究的进展。然而,由于水稻产量性状是由多个基因控制的复杂数量性状,且容易受环境变化的影响,寻找更多与水稻产量性状相关的基因对于水稻高产育种具有重要意义。基因编辑在作物改良和新育种方法的发展方面具有重要意义,然而对于缺乏生物信息学背景的研究人员来说,分析基因编辑的编辑效率和结果是一项繁琐的过程。为了解决这一问题,本研究采用Typescript编写,设计了一款软件。该软件旨在建立一个简单高效的系统,用于分析高通量基因组编辑测序数据,使研究人员能够快速分析基因编辑效率和结果。该软件主要包含了以下几个重要的特性和功能:1.对双端测序文件进行自动合并。2.根据测序序列对批量数据进行样本拆分。3.将测序序列比对到靶位点,进行基因编辑突变类型的分析和统计。该软件的开发简化了基因编辑数据分析的过程,为用户提供了一个界面友好的分析平台,能够为研究人员提供准确而可靠的结果。该软件的应用可以帮助基因编辑领域的研究人员快速、准确地分析基因组编辑测序数据,从而为基因编辑效率和结CX-5461分子量果的评估提供支持。水稻种子的生长发育十分关键,品质、产量相关的基因参与了种子的发育过程。为了深入挖掘与水稻产量相关的基因功能,为后续水稻高产育种提供参考依据,我们从水稻基因表达数据库中筛选了 310个种子特异或优先表达的基因,设计了 375个编辑位点进行CRISPR基因组编辑,并利用开发的分析软件对这310个基因编辑结果进行分析,最终建立了水稻种子发育相关基因数据库。该数据库包含了查询种子性状相关基因在不同组织和时期的表达,查询突变体基因型和对应表型,以及和亲本对照进行表型的比较等重要功能,为研究人员提供了一个平台,有助于进一步研究水稻种子发育机理。这对于促进水稻产量提高以及研究水稻高产育种Infections transmission模式具有潜在的价值。通过本研究中开发的基因编辑分析软件和水稻种子发育相关基因数据库,研究人员能够更加高效地分析基因编辑结果,并深入了解水稻种子发育的关键基因和调控机制。这将在水稻种子形成和发育的分子机理揭示方面发挥积极作用,为优化作物改良和新育种Talazoparib纯度方法提供潜在的应用价值,从而为进一步改良水稻品种提供参考。