GEO数据挖掘结合网络药理学及分子对接技术探究托里消毒散治疗克罗恩病的潜在机制

目的 通过生物信息学数据挖掘方法寻找克罗恩病相关基因,使用网络药理学方法及分子对接技术研究托里PF-02341066半抑制浓度消毒散治疗克罗恩病的作用靶点与潜在的作用机制。方法 克罗恩病的相关基因从基因表达综合数据库(GEO databapopulation precision medicinese)、孟德尔遗传数据库(OMIM)与人类遗传数据库(Gene card)获取,在TCMSP数据库与UniProt数据库确定托里消毒散组方成分的活性化合物和对应靶点,并通过Cytoscape软件实现疾病-复方调控网络构建,对疾病与托里消毒散复方交叉基因进行PPI网图构建并确定核心基因靶点,进行基因本体论(GO)生物功能分析和基因组的京都百科全书(KEGG)通路富集分析来阐明发挥作用的生物功能与分子通路,对核心化合物成分与核心靶点使用分子对接技术验证其结合能力。结果 克罗恩病相关基因合并去重后共得到922个,中药复方相关活性化合物241个,经Durgbank校对得到123个复方相关基因,疾病-复方交叉基因共23个,网络药理学选取出的核心化合物是槲皮素、木犀草素、Erastin纯度非瑟酮、山柰酚、甘草查尔酮A,PPI网图确定的核心基因靶点是ALB、IL6、ESR1、PPARG、VEGFA、EGFR。交叉基因的GO分析提示基因富集在DNA结合转录因子活性的调节、脂质储存的调节等方面,KEGG通路富集在多个癌症、TNF、NF-κB通路等;分子对接验证显示化合物配体与蛋白受体的结合能力良好。结论 托里消毒散组方成分可能通过相关受体蛋白作用于多种癌症、TNF、NF-κB通路,来调节炎症、免疫机制控制克罗恩病的发展。