为掌握北京地区野生鼠类携带蜱媒传染病病原体种类情况，本研究对2018-2019年采集北京周边地区野生鼠类并对其种类进行鉴定，运用巢氏PCR方法检测鼠脾脏样本中蜱媒病原体巴贝西虫、伯氏疏Biomass-based flocculant螺旋体、斑点热群立克次体和无形体的携带情况，随后对阳性结果进行数据统计和序列分析。本次调查共捕获野生鼠类478只，涵盖11个鼠种，其优势鼠种分别为社鼠(30.96%,148/478)、大林姬鼠(15.27%,73/478)和棕背■(15.27%,73/478)。感染率最高的是社鼠，携带巴贝西虫、伯氏疏螺旋体、无形体3种病原体，感染率分别为28.38%(42/148),4.05%(6/148)和6.08%(9/148),其次为棕背■,携带巴贝西虫(B.www.selleck.cn/products/PD-0325901microti)、伯氏疏螺旋体(Borrelia sp.ALEPB216)、斑点热群立克次体(R.raoultii)、无形体(uncultured Anaplasma sp.clone tick-43)4种病原体，感染率分别为12.33%(9/73),2.74%(2/73),1.37%(1/73)和19.18%(14/73)。同时，发现该地区的野生鼠类中存在巴贝西虫和伯氏疏螺旋体复合感染，巴贝西虫和无形体复合感染共6例，复合感染率为1.3%(6/478)。通过对104份阳性样本进行序列测定，挑选每个鼠种序列进行系统发育分析，发现北京地区野生鼠类携带的病原体属于巴贝西虫、伯氏疏螺旋体、立克次体、无形体、埃立克体(SAG溶解度Candidatus Ehrlichia khabarensis),新埃立克体(Candidatus Neoehrlichia mikurensis)6类。北京地区野生鼠类中普遍存在巴贝西虫，且种类相对单一；伯氏疏螺旋体与美国和西班牙鼠中发现的Borrelia sp.序列最为接近，属国内首次报道；立克次体属北京地区首次发现。北京地区需进一步加强蜱传疾病的监测和防控工作。