中国首例境外输入性新冠肺炎病例SARS-Co V-2全基因组序列分析

目的 分析宁夏DNA Damage/DNA Repair抑制剂发现的中国首例输入性新冠肺炎病例病毒全基因组序列与遗传特性。方法 病例咽拭子标本进行病毒核酸提取和实时荧光RT-PCR检测,通过高通量测序获取病毒全基因组序列;从NCBIGen-Bank数据库和国家生物信息中心(CNCB)获取77条新冠病毒全基因组序列进行基因特征和系统进化分析。结果 根据病例流行病学史,确定其为中国首例境外输入病例,通过高通量测序,LGK-974 IC50获得了感染该病例SARSCoV-2的全基因组序列(29 903 bp),同源性分析表明,该病毒具有3个与国内株均不一致的SNP位点(G11083T、T11244C和T11318C),但为错义突变,不引起抗原变化;系统发育分析表明,该病毒与土耳其、巴基斯坦和缅甸等来源的毒株位列同一分支,处于LineageB.2进化分支,具有较近的亲缘关系,而与国内流行株(处于LineageB.1分支)处于不同的进化支,亲缘关系较远。结论 该病例为中国首例境外输入新冠肺炎感染病例,结合病例流行病学史和病毒基因组特征,证实该病例来源于伊朗,处于LineageB.2进化分支,需加强不同地区境外输入病例监测和病Biogenic VOCs毒全基因组测序。