基于生物信息学分析焦亡相关基因在结肠癌预后中的价值

目的:利用生物信息学探讨焦亡相关基因在结肠癌患者预后中的价值。方法:从TCGA和GTEx数据库中提取正常结肠组织和结肠癌组织的焦亡相关基因,并进行差异性分析。根据焦亡相关基因表达量对TCGA队列中的患者进行聚类及分型,对分型存在差异的基因进行单因素COX分析、lasso回归分析并构建预后模型。在GSE39582中对该预后模型进行验证。应用单因素和多因素COX回归分析风险模型、临床性状与结肠癌患者预后的相关性。对风险差异表达基因进行GO富集分析、KEGG通路分析和ssGSEA分析。结果:47个焦亡相关基因在正常组织和结肠癌组织中表达存在差异性(P<0.05)。在预后模型中,患者生存时间和状态、临床分级、病理分期存在显著差异(P<0.001)。GO和PS-341采购KEGG分析发selleck产品现风险差异基因在免疫相关通路上显著富集。ssGSEA分析提示高风险组和低风险组患者间免疫细胞浸润和genomics proteomics bioinformatics免疫功能存在差异。结论:焦亡相关基因可评估结肠癌患者的预后,且可能调节结肠癌免疫相关通路。