无花果病毒CP基因克隆及遗传多样性分析

无花果花叶病毒（Fig mosaic virus,FMV）是一种RNA病毒，严重影响无花果的品质与产量。2019—2020年连续2 a从山西省临汾市无花果ROCK抑制剂基地随机采集被FMV感染的新鲜无花果叶片119份，经RT-PCR获得CDS-3201P基因，并进行序列分析，通过分析FMV分离株的遗传变异和种群结构，从多维度分析FMV的遗传多样性，旨在为无花果花叶病毒的分类、分子特征、进化机制以及致病机理的研究奠定基础，为解释FMV病毒分子结构、感染率高和进化程度提供有力证据。RT-PCR鉴定结果证实，53份样品为FMV阳性，从阳性样品中分离、测序、克隆得到12个新的FMV分离物；将12个分离物与在线数据比对，获得在线的37个分离物；对49个分离物进行系统发育分析得出，这些分离Expanded program of immunization物来自10个国家，分布范围广，根据亲缘关系分为6个组，且与地理位置无关。进一步分析核酸和氨基酸一致性，49个CP基因核苷酸一致率和氨基酸一致率分别为91.41%～100%和89.33%～100%。结果发现，CP基因在进化过程中具有高度保守性且突变率较低。偏离中立性检验显示，FMV种群极大可能处于种群扩张状态。选择压和重组分析结果表明，负向选择可能是FMV分子变异的重要原因。