目的 以中医“异病同治”理论为依据，采用网络药理学与分子对接方法探究金匮肾气丸对多囊卵巢综合征和甲状腺功能减退的作用机制。方法 自2022年3—10月通过中药系统药理学数据库与分析平台（TCselleck抑制剂MSP）检索获取金匮肾气丸活性成分及潜在靶点，利用DrugBank、GeneCards数据库获取疾病靶点，将两者取交集获取共有靶点，通过STRING11.5数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络，使用Cytoscape 3.7.1构建金匮肾气丸“药物-疾病-靶点”网络，利用R语言对共有靶点进行富集分析，运用SYBYL-X 2.0软件进行分子对接。结果 筛得疾病与药物共有靶点65个，核心靶点主要涉及血管内皮生长因子A(VEGFA)、白细胞介素-6(IL-6)、肿瘤坏死因子α(TNF-α)、胱Digital PCR Systems天蛋白酶-3(CASP-3)、细胞肿瘤抗原p53(TP53)、基质金属蛋白酶-9(MMP-9)等，潜在靶点主要富集在AGE-RAGE信号通路、癌症的途径、PI3K-Akt信号通路、胰岛素抵抗、JAK-STAT信号通路等多条信号通路中。结论 金匮肾气丸中多种活性成分通过多靶点、多途径发挥抑制炎症反应及细胞凋亡、促进组织血管生成等作用，初步揭示了金匮肾气丸“异病同治”多囊卵巢综合征与甲状腺功能减退的潜在靶点与现代生物学机制，为深入研究开Smoothened Agonist体外展实验及临床应用提供参考。