基于生物信息学和网络药理学探究左金丸治疗幽门螺杆菌相关性溃疡的分子机制

目的 运用网络药理学和生物信息学方法探究左金丸治疗幽门螺杆菌(Hp)相关性溃疡(PU)所涉及的分子机制及关键基因。方法 通过TCMSP数据库筛选左金丸的活性Medical law成分及作用靶点;通过GEO数据库检索Hp感染胃黏膜上皮的基因表达谱芯片数据;对芯片数据进行均一化处理并分析差异表达microRNA;利用Starbase搜索显著性差异表达microRNA靶基因;提取左金丸作用靶点和Hp相关性PU关键致病基因的交集;采用Metascape对交集基因进行GO功能分析;运用GSEA对交集基因进行KEGG通路富集分析。结果 检索到44种左金丸活性成分和891个作用靶寻找更多点;从GSE19769芯片中筛选出10个显著性差异表达microRNA;查找到显著性差异表达microRNA靶基因684个;取两者交集得到BIRC5、HIF1A、HSP90AB1等特异性基因;GO功能分析涉及翻译后蛋白修饰、细胞周期调节等生物过程,细胞质、细胞核等细胞成分,蛋白连接酶结合、蛋白质结合等分子功能;左金丸治疗Hp相关性PU涉及的信号通路包括MAPK信号通路、WNT信号通路、癌症相关通路selleck等。结论 结果表明左金丸治疗Hp相关性PU主要通过调控BIRC5、HIF1A、HSP90AB1等关键基因参与构成的MAPK信号通路、WNT信号通路等发挥作用。