基于氧化应激基因构建肝细胞癌预后模型及潜在中药预测分析

目的 肝细胞癌(hepatocellular carcinoma, HGSK2118436价格CC)是一种具有高侵袭性、诊断延迟和不良预后的肿瘤。本研究旨在构建一个基于氧化应激基因的HCC预后模型,并Medial sural artery perforator探索与该模型相关的中药成分。方法 研究使用癌症基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)和基因表达集(gene expression omnibus, GEO)中的数据集,鉴定与氧化应激相关的差异表达基因。通过单变量和多变量Cox回归以及Lasso回归分析,构建一个用于预测HCC患者预后的模型。利用Coremine Medicine数据库预测购买NN2211模型基因潜在的相关中药成分,并进行归经和性味聚类以及分子对接分析。验证试验:采用MTT法检测预测中药马钱子和龙葵水提液对Hep3B细胞增殖的影响;使用Western blot检测马钱子和龙葵水提液对细胞中SCL7A11蛋白水平的调控。结果 在氧化应激相关基因中,EZH2和SLC7A11基因可用于构建预后模型。预测模型模型基因相关的中药主要归肝经、味苦和性寒。分子对接分析表明,龙葵中的5′-甲氧基松脂素和马钱子中的马钱子碱N-氧化物分别与SLC7A11的247号丙氨酸(Affinity=-11.0)和198号赖氨酸(Affinity=-10.2)具有较强的结合能力。实验证实,马钱子和龙葵水提取物对Hep3B细胞增殖呈浓度和时间依赖性抑制作用,并减少了Hep3B细胞中SLC7A11蛋白的表达。结论 本研究成功构建了一个基于氧化应激基因的个体化HCC预后模型,并预测了与模型基因相关的潜在中药成分。